Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FERMT3Q86UX7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FERMT3Q86UX7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms