Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX20Q7Z614 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX20Q7Z614 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms