Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP9Q7RTR0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLRP9Q7RTR0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms