Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2AQ7L0J3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SV2AQ7L0J3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SV2AQ7L0J3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms