Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 ITGA6-210ENST00000475302 577 ntTSL 310.05□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 20.4
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SND1Q7KZF4 CD59-205ENST00000437761 758 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-9■■■■□ 20.4
SND1Q7KZF4 CD59-214ENST00000534312 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.652e-9■■■■□ 20.4
SND1Q7KZF4 CD59-207ENST00000525763 789 ntTSL 310.67□□□□□ -0.72e-9■■■■□ 20.4
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SND1Q7KZF4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.641e-7■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-7■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 SERPINE2-203ENST00000409840 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.821e-7■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 STT3A-213ENST00000531001 325 ntTSL 37.09□□□□□ -1.274e-18■■■■□ 20.2
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SND1Q7KZF4 GLT8D1-208ENST00000480080 897 ntTSL 37.17□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 LDLR-210ENST00000559340 605 ntTSL 59.66□□□□□ -0.863e-7■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.75e-9■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 CTSH-216ENST00000534268 622 ntTSL 519.37■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 PRPF19-203ENST00000539180 441 ntTSL 215.52■□□□□ 0.085e-9■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 PRPF19-204ENST00000539960 796 ntTSL 213.93□□□□□ -0.185e-9■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 PRPF19-202ENST00000535326 779 ntTSL 513.67□□□□□ -0.225e-9■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 SDCBP-211ENST00000523441 543 ntTSL 212.09□□□□□ -0.475e-10■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.745e-10■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.781e-7■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.235e-12■■■■□ 20.2
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SND1Q7KZF4 ELMOD2-207ENST00000512057 767 ntTSL 56.12□□□□□ -1.435e-12■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.455e-10■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 TFRC-213ENST00000482479 540 ntTSL 37.68□□□□□ -1.185e-13■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 TFRC-207ENST00000463356 533 ntTSL 36.91□□□□□ -1.31e-11■■■■□ 20.2
SND1Q7KZF4 HLA-C-208ENST00000487245 1880 nt28.56■■■□□ 2.162e-9■■■■□ 20.1
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