RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
PTPRC-212ENST00000491302 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.38■■■□□ 2.77
PTPRC-212ENST00000491302 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PTPRC-212ENST00000491302 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PTPRC-212ENST00000491302 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRC-212ENST00000491302 FOXD1Q16676 465 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ADRA2BP18089 450 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRC-212ENST00000491302 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRC-212ENST00000491302 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRC-212ENST00000491302 KCNA4P22459 653 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MSH5O43196 834 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRC-212ENST00000491302 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRC-212ENST00000491302 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRC-212ENST00000491302 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRC-212ENST00000491302 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRC-212ENST00000491302 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRC-212ENST00000491302 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRC-212ENST00000491302 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB22O15209 634 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRC-212ENST00000491302 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRC-212ENST00000491302 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SLC4A2P04920 1241 aa21.33■■□□□ 1.01
PTPRC-212ENST00000491302 POTEDQ86YR6 584 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRC-212ENST00000491302 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRC-212ENST00000491302 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRC-212ENST00000491302 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRC-212ENST00000491302 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP8Q14318 412 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRC-212ENST00000491302 APLP2Q06481 763 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRC-212ENST00000491302 RNF39Q9H2S5 420 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRC-212ENST00000491302 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRC-212ENST00000491302 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRC-212ENST00000491302 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
PTPRC-212ENST00000491302 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
PTPRC-212ENST00000491302 FBLN2P98095 1184 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRC-212ENST00000491302 CAPN15O75808 1086 aa19.64■□□□□ 0.73
PTPRC-212ENST00000491302 SPDYE4A6NLX3 237 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRC-212ENST00000491302 POLA2Q14181 598 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRC-212ENST00000491302 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO3Q9UK99 471 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRC-212ENST00000491302 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
PTPRC-212ENST00000491302 PROM2Q8N271 834 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRC-212ENST00000491302 ABCB7O75027 752 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRC-212ENST00000491302 SLC24A1O60721 1099 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRC-212ENST00000491302 DSG3P32926 999 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRC-212ENST00000491302 VASPP50552 380 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRC-212ENST00000491302 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRC-212ENST00000491302 SPDYE6P0CI01 402 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRC-212ENST00000491302 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRC-212ENST00000491302 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRC-212ENST00000491302 OSCARQ8IYS5 282 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRC-212ENST00000491302 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRC-212ENST00000491302 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRC-212ENST00000491302 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL34Q8N239 644 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRC-212ENST00000491302 SPOCK2Q92563 424 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRC-212ENST00000491302 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRC-212ENST00000491302 PKD2Q13563 968 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRC-212ENST00000491302 MIER1Q8N108 512 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHG5O94827 1062 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRC-212ENST00000491302 PLCB2Q00722 1185 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRC-212ENST00000491302 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PTPRC-212ENST00000491302 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRC-212ENST00000491302 AKT1S1Q96B36 256 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRC-212ENST00000491302 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PTPRC-212ENST00000491302 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRC-212ENST00000491302 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM41Q8WV44 630 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRC-212ENST00000491302 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRC-212ENST00000491302 RGL2O15211 777 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRC-212ENST00000491302 GSE1Q14687 1217 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRC-212ENST00000491302 PRR29P0C7W0 189 aa18■□□□□ 0.47
PTPRC-212ENST00000491302 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
PTPRC-212ENST00000491302 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
PTPRC-212ENST00000491302 VSIG10Q8N0Z9 540 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRC-212ENST00000491302 NUBP1P53384 320 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRC-212ENST00000491302 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRC-212ENST00000491302 CREBZFQ9NS37 354 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRC-212ENST00000491302 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF8Q5TAQ9 597 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP44Q96MT7 982 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRC-212ENST00000491302 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.84■□□□□ 0.45
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