Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms