Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYDE1Q6ZW31 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms