Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM47EQ6ZV65 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms