Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA6Q6ZSJ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms