Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC73Q6ZRK6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms