Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMCO3Q6UWJ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCO3Q6UWJ1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCO3Q6UWJ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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