Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC137Q6PK04 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC137Q6PK04 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms