Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC27A1Q6PCB7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC27A1Q6PCB7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC27A1Q6PCB7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms