Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND1BQ6P3S1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND1BQ6P3S1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND1BQ6P3S1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms