Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EDC4Q6P2E9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EDC4Q6P2E9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms