Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP5Q6NZY7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP5Q6NZY7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms