Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT80Q6KB66 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms