Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRAMD4Q6IC98 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRAMD4Q6IC98 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms