Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX8Q68G74 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX8Q68G74 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms