Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GGNBP1Q5YKI7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GGNBP1Q5YKI7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms