Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf220Q5T0J3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf220Q5T0J3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms