Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRMPD1Q5SYB0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
FRMPD1Q5SYB0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRMPD1Q5SYB0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms