Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C10orf55Q5SWW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C10orf55Q5SWW7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms