Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HABP4Q5JVS0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms