Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHC1Q5JVL4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHC1Q5JVL4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms