Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KHDC3LQ587J8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KHDC3LQ587J8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms