Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD39Q53RE8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD39Q53RE8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms