Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTXN3Q4LDR2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms