Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB8Q3ZCM7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB8Q3ZCM7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms