Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BBS9Q3SYG4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms