Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRTAP27-1Q3LI81 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP27-1Q3LI81 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms