Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UVSSAQ2YD98 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UVSSAQ2YD98 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms