Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMU1Q2TAY7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMU1Q2TAY7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms