Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VWC2Q2TAL6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VWC2Q2TAL6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms