Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFX7Q2KHR2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFX7Q2KHR2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RFX7Q2KHR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX7Q2KHR2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX7Q2KHR2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms