Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSPP1Q1MSJ5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSPP1Q1MSJ5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms