Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUSP6Q16828 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP6Q16828 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms