Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMA3Q16787 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
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