Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NRF1Q16656 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms