Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STX1AQ16623 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX1AQ16623 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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