Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TAF9Q16594 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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