Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYPL1Q16563 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYPL1Q16563 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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