Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNRNP35Q16560 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNRNP35Q16560 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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