Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNAPC1Q16533 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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