Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NCOA1Q15788 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
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NCOA1Q15788 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
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NCOA1Q15788 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NCOA1Q15788 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
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