Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX1-1Q15270 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NKX1-1Q15270 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX1-1Q15270 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms