Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRD3Q15059 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRD3Q15059 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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