Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSPNQ14714 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSPNQ14714 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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