Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GINS1Q14691 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GINS1Q14691 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms